يحتوي شعار كلية العلوم الاسلامية على القبة الخضراء التي ترمز الى المسجد النبوي الشريف وداخلها القرآن الكريم الذي يمثل رمز الدستور الاسلامي وكذلك يحتوي على شعار الجامعة الذي بداخله البوابة الخاصة بالتدريسيين والآية القرآنية تخص التشريع الاسلامي موافقة لمناهج العلوم الاسلامية 

اما اللون الارزق يرمز للسماء والعلو واللون الاصفر للأرض وساكنيها كون دين الإسلام للثقلين